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私にとって至当なデータベースは何でしょうか

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データベースかGNUnetのどちらも使っていないならば、デフォルトのsqliteにしてください。 こちらで述べられているとおり、mysqlモジュールはマニュアルでセットアップする必要があります。 mysqlはパフォーマンスに優れ、データベースを内部エラーから復旧させることができるのですが、そのインストールは他のどの選択肢よりもより困難です。